En un mundo oscuro ambientado en el siglo XIX, la historia gira en torno a Allen Walker, un joven con habilidades especiales. Su brazo izquierdo puede convertirse en un arma anti-Akuma, y su ojo maldito le permite ver demonios, los Akumas, incluso cuando fingen ser humanos. Los Akumas son máquinas demoníacas creadas por el siniestro Conde Milenario, cuyo propósito es destruir a la humanidad. Después de entrenar bajo el misterioso General Cross Marian, Allen se une a los Exorcistas de la Orden Negra, una organización secreta que trabaja para eliminar a los Akumas y frustrar los planes del Conde. Pero a medida que se involucra más en esta guerra, Allen descubre verdades indescriptibles sobre su propia existencia y los verdaderos orígenes de la "Inocencia", el poder que los exorcistas tienen para luchar. D. Gray Man es un relato intensamente dramático de sacrificio, redención y el conflicto del bien contra el mal, combinando elementos de acción, misterio, horror y drama.